Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNAPC1Q16533 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SNAPC1Q16533 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SNAPC1Q16533 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SNAPC1Q16533 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNAPC1Q16533 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SNAPC1Q16533 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNAPC1Q16533 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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