Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNA1EQ15878 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNA1EQ15878 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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