Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ALX1Q15699 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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