Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TLR1Q15399 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms