Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VGLL4Q14135 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms