Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK13Q14004 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
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