Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCINQ13939 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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