Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ATRQ13535 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ATRQ13535 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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