Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TRAF2Q12933 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TRAF2Q12933 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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TRAF2Q12933 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRAF2Q12933 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRAF2Q12933 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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TRAF2Q12933 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF2Q12933 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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