Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TP53BP1Q12888 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TP53BP1Q12888 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms