Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CGNL1Q0VF96 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CGNL1Q0VF96 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms