Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ACSM1Q08AH1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms