Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLEQ07864 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLEQ07864 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLEQ07864 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLEQ07864 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLEQ07864 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
POLEQ07864 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLEQ07864 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms