Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
TNP2Q05952 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms