Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BEX3Q00994 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BEX3Q00994 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms