Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MDM2Q00987 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDM2Q00987 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDM2Q00987 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDM2Q00987 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDM2Q00987 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MDM2Q00987 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MDM2Q00987 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MDM2Q00987 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms