Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IRX3P78415 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IRX3P78415 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms