Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
H2BFSP57053 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2BFSP57053 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms