Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CAV3P56539 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CAV3P56539 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CAV3P56539 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CAV3P56539 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms