Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARFIP2P53365 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ARFIP2P53365 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms