Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRIM1P49642 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRIM1P49642 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms