Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATRXP46100 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRXP46100 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRXP46100 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRXP46100 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRXP46100 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRXP46100 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATRXP46100 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATRXP46100 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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