Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE6BP35913 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDE6BP35913 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms