Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
TM4SF1P30408 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TM4SF1P30408 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms