Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRB3P28472 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRB3P28472 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms