Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LAMA1P25391 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LAMA1P25391 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms