Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FGFR4P22455 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms