Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRHP20396 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRHP20396 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRHP20396 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRHP20396 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRHP20396 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRHP20396 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRHP20396 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TRHP20396 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TRHP20396 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TRHP20396 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms