Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HPGDP15428 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPGDP15428 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPGDP15428 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HPGDP15428 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms