Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMC1P11047 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms