Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMIGD3P0DMS9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMIGD3P0DMS9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms