Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RGPD1P0DJD0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RGPD1P0DJD0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms