Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
C4AP0C0L4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C4AP0C0L4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms