Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMP10P09238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMP10P09238 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MMP10P09238 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MMP10P09238 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP10P09238 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms