Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CTSVO60911 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CTSVO60911 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSVO60911 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSVO60911 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSVO60911 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms