Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KIAA0556O60303 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KIAA0556O60303 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms