Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTATSF1O43719 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTATSF1O43719 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms