Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COCHO43405 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COCHO43405 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COCHO43405 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COCHO43405 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COCHO43405 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COCHO43405 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms