Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF3O43395 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRPF3O43395 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRPF3O43395 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRPF3O43395 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRPF3O43395 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms