Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXA3O43365 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXA3O43365 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXA3O43365 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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