Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPATO15228 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms