Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms