Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYNMO15061 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SYNMO15061 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYNMO15061 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms