Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLRMTO00411 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms