Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MBD3L3A6NE82 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms