Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KNSTRNQ9Y448 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KNSTRNQ9Y448 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms