Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RCE1Q9Y256 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms