Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FBXO4Q9UKT5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms