Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCMF1Q9P0J7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms