Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC4BQ9NT99 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC4BQ9NT99 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms